截至2022年末，图书馆已有中西医药书籍和期刊93800余册，其中包含部分英文、中英对照、日文、韩文书籍和期刊以及阅览光盘、课件、视频等。图书馆除收藏大量的中医药书籍外，还有部分西医学、历史、文学、哲学、人文类书籍，是目前东南亚最大的中医药分类藏书的图书馆。图书馆内还收藏有新加坡中医师公会成立70年来的活动剪报、会议记录、照片和东南亚多种中医药刊物。
馆藏图书是按王云五先生的《中外图书统一分类法》进行分类，之后对其做了部分修订，便于兼容中西与古今医药书籍于一体。现分为总类、基础学、内科学、外科五官科学、妇儿科学、诊断学、方药学、治疗学、针灸学、公共卫生及其他十大类。
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