当新加坡还是英国殖民地时，是由移民自中国的中医师为华人治病。英殖民地政府颁布并施行移民限制条例后，来自中国的中医师逐渐减少，而新马一带的中医师也逐渐老迈。新加坡中医师公会先贤意识到，我国中医界面对后继乏人的危机，而中华施诊所正是培育中医药人才的理想场所。另一方面当时也出现一些不法之徒利用民众信任中医药的心理，到处招摇撞骗，江湖郎中猖獗一时。为了传授系统的中医学，担负起培训新马两地中医接班人的任务，新加坡中医师公会开始筹办一间中医专门学校，旨在实现有系统的公开传授中医学，培养中医药人才，以负起培训新加坡、马来西亚两地中医接班人的任务。1953年，新加坡中医师公会创办“中医专门学校”，并向教育部办理了注册手续，继而进行招生和举行入学考试，录取第一批学员约30余人。
　　 中医专门学校的教学方针是“中医为主，西医为辅”，校训是“慎勇端勤”。当时采用四年兼读制，学习上注重理论、临床实习。课本教材全由在校讲师自行编写，直到1962年才部分改用中国中医院校所采用的教材。1976年，为了发展我国的中医教育，学校更名为“新加坡中医学院”，并在1978年搬进了设备完善、环境清幽的大巴窑中华医院大厦。 新加坡中医学院的中医课程自1983年起改为五年兼读制，对学生的入学资格严格审定，凡是有志于学习中医者，必须具备政府统一考试高中或以上的程度。第五年的课程是提高学员的理论和临床医疗技术。

　　 1994年我国卫生部传统中医药委员会“传统中医中药”报告中，建议提升中医培训课程改为三年全日制或六年兼读制课程。学院根据这项建议，于1996年把学制由五年兼读制提升为六年兼读制。
　　随着时代的进步，我国民众对中医学术和医疗水平的要求和期望也提高。我国的中医专业也有从普通科转向专科专病的趋势。因此学院的办学方针也朝着更深广的方向发展。新加坡中医学院和中华医院相互配合，设立了专科专病小组，并定期聘请中国著名中医药大学的教授前来学院指导临床和教学，以便进一步提高学院的学术水平。
　　为配合政府制定的针灸师和中医师的注册，学院受卫生部委托，于2001年开始先后承办针灸和中医进修课程，让需要参加统一考试的执业者进修，协助他们做好准备，为想成为注册针灸师和中医师铺路。
　　2006年为进一步提升中医学的培训水平，中医管理委员会要求中医专业文凭提升至本科水平。学院就此开办中医专业高级文凭（原为中医学士学位课程），学制分别改为五年全日制和七年兼读制。学员在修完所规定的中医科目，理论与临床考试及格并经“成绩与操行评定委员会”评定通过后，才能毕业及获颁文凭，而后可报考由中医管理委员会主办的新加坡中医师注册资格考试，通过者可成为注册中医师，并有资格在新加坡行医。

　　学院于2000年增设校外进修部（2001年更名为继续教育中心）。继续教育中心设立英语教学组，聘请英语讲员，开展双语中医课程与讲座，让英语源流的公众也有机会认识中医药。 为促进我国中医学术的发展，与东南亚及中国的中医院校建立了良好关系，并联合中国中医院校开办本科和研究生课程，包括与广州中医药大学联办的中医学士学位、硕士学位、博士课程；与南京中医药大学联办的硕士学位、博士课程。 目前，新加坡中医学院开办的课程有：中医专业高级文凭、针灸专业文凭（供新加坡注册西医/牙医修读）、中医健康管理师文凭、中华药膳师文凭、中华药膳师文凭、保健推拿师文凭、乐龄人士中医健康调护师文凭、中医儿童健康调理师文凭、中医助理证书、中医药基础证书、Certificate in TCM Assistant、Certificate in Basic Theory of TCM和中医继续教育课程。

　　新加坡中医学院自创办以来，已有 69年的光辉历史，为新加坡培育了4725名中医人才。新加坡中医学院已具有完整的中医高等教育体系，不仅获得卫生部认可，CPE法定注册（第4个4年），教育信托认证（第3个4年），而且通过ISO 9001国际认证，毕业医师也继承了新加坡中医师公会多年来的优良传统，投入义疗工作队伍，为我国各族病患提供优质的中医药医疗保健服务，从而赢得良好的社会声誉和广泛的国际影响。新加坡中医学院已成为东南亚历史最悠久、体制完善的中医专业培训学府，将继续进一步推动我国中医药事业的发展，为广大民众健康水平的提高多做贡献。